食道超声波内镜检查属于无创检查，检查过程中，一般没有明显的副作用。但是少数患者可能会出现恶心、呕吐、胸骨后烧灼感、轻微疼痛等副作用，需要积极进行处理。

1、恶心、呕吐：在进行食道超声波检查时，检查者在进食后，食物会进入食管，刺激食管黏膜，引起恶心、呕吐等症状。建议患者在检查前6小时内禁食，有利于检查的进行;

2、胸骨后烧灼感：食道超声波内镜检查时，若医生操作不当，可能会对食管黏膜造成一定的损伤，产生胸骨后烧灼感。一般不需要特别处理，休息一段时间后可以缓解;

3、轻微疼痛：由于食道超声波内镜是通过口腔进入食管内，进行检查，所以可能会刺激食管黏膜，患者出现轻微疼痛感。但是疼痛一般可以耐受，不会特别剧烈;

4、咽喉疼痛：食道超声波内镜检查时，若医生操作不当，在对咽喉黏膜进行刺激时，可能会引起咽喉疼痛。但是这种疼痛一般不会持续过久，等到检查结束后，疼痛症状就会消失。

除了上述副作用外，少数患者进行食道超声波内镜检查后，还可能会出现水肿、充血等症状。但是这些症状不会特别严重，一般不需要特别处理。进行食道超声波内镜检查时，医生需要叮嘱患者注意配合医生进行吞咽动作，以免出现不良反应。另外检查后不要立即进食，以免食物呛入气道，引起窒息。